Sein erstes Spiel bestritt er am 19.Mai 1946 mit einem 1:6 gegen Lambach und trat noch im selben Jahr dem Oberösterreichischen Fussballverband bei, wo er in die 2.Klasse D eingeteilt wurde. Von 1974 bis 1980 spielten die Schwanenstädter erstmals in der 2. Landesliga, die Rückkehr gelang wieder 1995. Hier konnte sich der Verein bald etablieren und erreichte schließlich 2000 mit 15 Punkten Vorsprung den Aufstieg in die viertklassige Landesliga. Der SC Schwanenstadt setzte dabei zu einem überraschenden Durchmarsch in der Regionalliga Mitte an, denn aufgrund des Aufstiegsverbots für Meister LASK Linz Amateure (Profi- und zweite Mannschaft mussten nach damaliger Regelung durch mindestens eine Liga getrennt sein) sowie des Verzichts der anderen besserplatzierten Teams gelang der Aufstieg in der Debütsaison als Tabellen - Siebtenter. Durch Gewinn des neuen Hauptsponsors Schwan sowie die Fertigstellung des Stadion Vor der Au konnte sich der Verein von Anfang an problemlos in der Regionalliga halten. Erstmals voll gefüllt war das Stadion am 19. September 2001 im ÖFB - Cup gegen den Rekordsieger FK Austria Wien, der erst fünf Minuten vor Spielende den Siegestreffer erzielte. In der Saison 2004/05 wurde schließlich unter Trainer Andrzej Lesiak der Meistertitel in der regionalliga Mitte gewonnen und der Verein stieg damit in die zweithöchste Spielklasse Österreichs, die erste Liga, auf. Im ersten Zweitligajahr noch Tabellenneunter gelang 2006/07 unter Andreas Heraf mit dem zweiten Platz der bisherige Höhepunkt der Vereinsgeschichte. Nach finanziellen Problemen gab der Verein am 22.Januar 2008 bekannt, nach Niederösterreich zu übersiedeln und unter dem neuen Namen FC Magna Wiener Neustadt weiterzuspielen. Der Umzug wurde finanziell abgegolten. April 2008 wurde ein neuer Verein namens SC Schwanenestadt 08 gegründet, der in der oberösterreichischen 2. Klasse Mitte West an den Start ging. Mit 15 Punkten Vorsprung auf den zweitplatzierten Weibern und einem Torverhältnis von 100:24 konnte man iin der Saison 2008/09 den Meistertitel einfahren. Nach einigen Jahren in der 1.Klasse Süd konnte 2013/14 mit dem Meistertitel der Aufstieg in die Bezirksliga Süd erreicht werden. Im ersten Jahr in der BL konnten die Schwäne in einem Krimi den Aufstieg, durch die Relegation, in die Landesliga West realisieren. Seit der Saison 2016/2017 spielt der SCS 08 in der Landesliga West.
